文章来自于南京医科大学附属第一医院孙倍成教授课题组发表在nature communications上的工作。作者通过基因芯片技术在肝细胞癌患者肿瘤组织分离的T细胞中筛选差异表达的基因及lncRNA,并通过通路分析及数学算法发现可能存在的了lncRNA—protein调节方式,然后通过大样本病例进行验证。作者在细胞层面通过过表达及分子通路抑制剂证明了实验结论,并在小鼠体内做了相应验证。实验设计细致,证明完整严谨。
文章思路及结果
1、筛选
选择3例HCC患者肿瘤组织、外周血,健康志愿者外周血T细胞mRNA及lncRNA芯片比较及PCA计算,发现CD4+ T细胞中EGFR-lncEGFR-Transcription factor存在明显反馈环,参加多种调节反应,被作为研究兴趣。
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